Fenilalanin Amonyak Liyaz (PAL; EC 4.3.1.24), fenilpropanoid yolunun ilk ve hız kısıtlayıcı enzimidir.
Bu enzim fenilalanin amino asidini, trans-sinnamik asit ve amonyak (NH₃)’a dönüştürür:
L−Fenilalanin→trans−Sinnamikasit+NH3
Bu reaksiyon, bitkide lignin, flavonoid, fenolik asit, tanen, antosiyanin ve fitoaleksin gibi savunma ve yapısal bileşiklerin sentezinin başlangıç noktasıdır.
Biyosentezi ve Düzenlenmesi
Arpada HvPAL1, HvPAL2, HvPAL3 genleri tanımlanmıştır; özellikle HvPAL1 yaprak ve köklerde yüksek ifade edilir.
PAL genleri, ışık, yaralanma, patojen saldırısı, UV radyasyonu, kuraklık ve soğuk stres ile uyarılır.
Salisilik asit (SA), jasmonat (JA) ve etilen (ET) hormonları PAL aktivitesini indükler.
Enzim sentezi fenilalanin düzeyi ve hücre içi redoks potansiyeli ile yakından ilişkilidir.
Fizyolojik Rolleri
Süreç
Rol
Tarımsal Önemi
Savunma tepkisi
Lignin ve fitoaleksin sentezi
Fungal ve bakteriyel patojenlere direnç
Fenolik metabolizma
Flavonoid, tanen, antosiyanin üretimi
Antioksidan koruma, UV toleransı
Lignifikasyon (odunlaşma)
Hücre duvarı güçlenmesi
Mekanik dayanıklılık artışı
Stres tepkisi
ROS azaltımı ve fenolik tamponlama
Kuraklık ve soğuk toleransı
Renk ve aroma bileşenleri
Flavonoid ve fenolik öncül oluşumu
Malt kalitesi ve renk profili
Arpada Özel Rolü
Arpada PAL, savunma metabolizmasının ana tetikleyicisidir.
Özellikle fungal patojen saldırısında (ör. Fusarium, Rhynchosporium) PAL ekspresyonu 6–12 saat içinde hızla artar.
PAL → Sinnamik asit → Ferulik asit → Lignin zinciri, hücre duvarını sertleştirerek patojen girişini engeller.
Aynı zamanda fenolik ara ürünler, POD ve PPO enzimleriyle oksitlenerek antimikrobiyal bileşiklere dönüşür.
Aktiviteyi Etkileyen Faktörler
Faktör
Artırıcı Etki
Baskılayıcı Etki
Açıklama
Işık (UV-A/UV-B)
Güçlü indüksiyon
Karanlıkta azalır
UV sinyali fenilpropanoid sentezini tetikler
Sıcaklık
20–30 °C optimum
>40 °C inaktivasyon
Enzim stabilitesi azalır
pH
8.0 optimum
<6.5 → düşük aktivite
Hafif alkali ortam ideal
Hormonlar
SA, JA, ET → ↑
ABA → ↓
Savunma sinyali bağlantılı
Beslenme
Nitrik oksit ve azot fazlalığı → ↓
Orta azot → ↑
Fenilalanin azot metabolizmasından türetilir
Metaller
Mn²⁺, Ca²⁺ stabilize eder
Cu²⁺, Hg²⁺ inhibe eder
Enzim yapısı metal duyarlı
Eksiklik ve Fazlalık Belirtileri
Durum
Belirti
Sonuç
Düşük PAL aktivitesi
Zayıf lignifikasyon, düşük savunma
Patojenlere duyarlılık artar
Fazla PAL aktivitesi
Aşırı fenolik birikimi
Renk koyulaşması, tat kusuru
Dengesiz aktivite
ROS ve fenolik dengesi bozulur
Hücre metabolizmasında stres artar
Uygulama Alanları
1. Bitki Savunması:
PAL aktivitesi, bitkinin patojen saldırısına tepkisini hızla başlatır.
Yüksek PAL ekspresyonu, fungal dayanıklılıkla doğrudan ilişkilidir.
2. Malt ve gıda endüstrisi:
PAL aktivitesi, maltın renk ve fenolik içeriğini etkiler.
Kontrollü aktivite, istenen aroma ve renk profilini sağlar.
3. Moleküler ıslah:
HvPAL genleri, biyotik ve abiyotik stres dayanıklılığı için ıslah çalışmalarında biyobelirteç olarak kullanılmaktadır.
Diğer Enzimlerle Karşılaştırmalı Rol
Enzim
Rol
PAL ile İlişki
PAL
Fenilalaninden fenolik öncüller üretir
Fenilpropanoid yolunun başlangıcı
C4H (Sinamat-4-hidroksilaz)
Sinnamik asidi p-kumarik aside dönüştürür
PAL ürününü kullanır
4CL (4-Kumarat KoA Ligas)
Fenolik asitleri aktive eder
PAL sonrası aşama
POD / PPO
Fenolik polimerizasyon
PAL substratlarını okside eder
CHS (Chalkon Sentaz)
Flavonoid sentezi
PAL türevleriyle çalışır
Araştırma Bulguları
Türkiye (Konya): Kuraklıkta PAL aktivitesi %120 artmış, lignin ve flavonoid düzeyi yükselmiştir.
İran: Fusarium enfeksiyonuna maruz arpalarda PAL aktivitesi ilk 12 saatte 4 kat artmış, mikotoksin etkisi azalmıştır.
Çin:HvPAL1 aşırı ekspresyonu, transgenik arpalarda fungal enfeksiyon oranını %40 azaltmıştır.
İspanya: Işık stresi altında PAL aktivitesi yüksek hatlarda fenolik koruma sayesinde klorofil yıkımı %25 azalmıştır.
Aktiviteyi Artıran Faktörler
UV ışığı, yaralanma, patojen saldırısı
SA, JA, ET hormonları
Orta sıcaklık (20–30 °C)
Fenilalanin zenginliği
Mn²⁺ ve Ca²⁺ iyonları
Aktiviteyi Baskılayan Faktörler
Aşırı azotlu besleme
Karanlık koşullar
ABA birikimi
Yüksek sıcaklık (>40 °C)
Ağır metaller (Cu²⁺, Hg²⁺)
Teknik Değerlendirme
PAL, arpada fenolik savunma ve lignifikasyon metabolizmasının kilit enzimidir.
Aktivitesi, hem hastalık direnci hem de renk–aroma oluşumu açısından belirleyicidir.
SOD–CAT–APX–POD–PPO–PAL zinciri, oksidatif stres–fenolik savunma bütünlüğünü sağlar.
Yüksek PAL aktivitesi, fungus ve UV stresine karşı avantaj; ancak malt kalitesinde renk kararması riski taşır.
Optimum koşullar:
pH: 8.0 ±0.2
Sıcaklık: 25–30 °C
SA veya JA indüksiyonu ile maksimum savunma etkisi.