Fenilalanin Amonyak Liyaz (PAL)
Fenilalanin Amonyak Liyaz (PAL) , ayçiçeğinde (Helianthus annuus) fenilpropanoid metabolizmasının başlangıç enzimi olup, savunma, lignin sentezi, renk pigmentleri (antosiyanin/flavonoid) üretimi ve stres toleransı gibi çok önemli biyolojik süreçlerde görev alır. Bu enzim, fenilalanin amino asidinden trans-sinnamik asit oluşturur ve böylece ikincil metabolit sentezinin ilk adımını başlatır.
1. Enzimin Tanımı ve Tepkimesi
Özellik
Açıklama
Tam Adı
Phenylalanine Ammonia-Lyase (EC 4.3.1.24)
Tepkime
L-Fenilalanin → trans-Sinnamik Asit + NH₃
Görev
Fenilalanin amino asidinden fenilpropanoid iskeletini başlatmak
Kofaktör
Fe²⁺ ve Mn²⁺ iyonları
Lokalizasyon
Sitoplazma ve kloroplast çevresi
2. Fenilpropanoid Yolak Özet Şeması
Fenilalanin
↓ (PAL)
Sinnamik Asit
↓
p-Kumarik Asit → Flavonoidler, Antosiyaninler, Lignin, Tanenler
PAL , bu zincirin ilk halkasıdır. Böylece bitki;
Savunma bileşikleri (fitolaleksinler, fenoller),
Yapısal polimerler (lignin, suberin),
Renk pigmentleri (antosiyanin, flavonoid) üretimini başlatır.
3. Ayçiçeğinde Fizyolojik Rolleri
Süreç
PAL Aktivitesi
Etki
Fungal enfeksiyon (Sclerotinia, Alternaria)
Artar
Fenolik savunma bileşikleri sentezlenir
UV ve ışık stresi
Artar
Flavonoid üretimi ve fotoproteksiyon
Kuraklık ve tuz stresi
Artar
Antioksidan fenoller birikir
Yaralanma ve mekanik stres
Artar
Lignin sentezi artar, doku sertleşir
Tohum olgunlaşması
Orta seviye
Lignifikasyon ve kabuk dayanıklılığı artar
4. PAL Gen Ailesi (Ayçiçeği)
Gen
Ekspresyon Alanı
Görev
HaPAL1
Yaprak ve sap
UV ve patojen yanıtı
HaPAL2
Kök
Tuz ve kuraklık dayanımı
HaPAL3
Çiçek ve tohum
Flavonoid sentezi, renk oluşumu
HaPAL4
Genç dokular
Hücre duvarı lignifikasyonu
5. Hormon ve Sinyal Etkileşimleri
Hormon / Sinyal
Etki
Sonuç
Salisilik Asit (SA)
Güçlü aktivatör
Patojen savunma genlerini tetikler
Jasmonik Asit (JA)
Aktivasyon
Yara ve böcek saldırısına yanıt
Etilen (ETH)
Sinerjik
Lignin üretimiyle dokusal sertleşme
Abscisik Asit (ABA)
Düzenleyici
Stres koşullarında fenol üretimini yönlendirir
6. Moleküler Özellikler
Özellik
Bilgi
Protein Uzunluğu
720–740 amino asit
Moleküler Ağırlık
77–83 kDa
pI (izoelektrik nokta)
6.1–6.5
Optimum pH
8.5–9.0
Optimum Sıcaklık
35–40 °C
Kofaktör
Fe²⁺, Mn²⁺
Yapısal Motif
Ala-Ser-Gly-Lys (aktif bölge çevresi)
7. PAL Aktivitesini Artıran Faktörler
UV ışığı
Yaralanma / mekanik stres
Salisilik asit uygulamaları
Patogen saldırısı (Sclerotinia sclerotiorum, Botrytis cinerea)
Fungal elicitor’lar (kitin, glukan)
8. Tarımsal ve Biyoteknolojik Önemi
Uygulama
Amaç
Etki
Hastalık Direnci Geliştirme
PAL gen ekspresyonunu artırma
Mantar ve bakteri direnci artar
Antioksidan Zenginlik
Flavonoid üretimini tetikleme
Besin değeri ve dayanıklılık artışı
Bitki Islahı
PAL gen seçilimi
UV ve tuz toleransı yüksek hatlar
Endüstriyel Kullanım
Fenolik bileşik üretimi
Doğal antioksidan ve boya hammaddesi
9. Özetle
Fenilalanin Amonyak Liyaz (PAL) , ayçiçeğinde fenolik savunma sisteminin ve lignin sentezinin anahtar enzimidir.
Salisilik asit ve jasmonat sinyalleriyle aktive olur.
Bitkinin hastalık, UV, tuz ve kuraklık stresine dayanıklılığını artırır.
PAL gen ailesi (HaPAL) , hem biyotik hem abiyotik stres yönetiminde kritik rol oynar.